Título do projeto

Biologia Estrutural – Estudando a estrutura da proteína S do Sars-CoV-2 usando deep learning – vídeo da apresentação

Tutor

Victor Klein de Sousa (University of Copenhagen)

Estudantes 

Cecília Rocha Cruz

Gabriela Martins dos Santos

Matteo Zunno Bocchini

Raphael Lima Alves

Descrição do projeto

O paradigma que guia a Biologia estrutural pressupõe que se conhecemos a estrutura de uma biomolécula (proteína ou DNA, por exemplo) podemos descrever a sua função. Durante anos, o trabalho dos cientistas na área se embasou em três etapas: utilizar técnicas de biologia molecular para expressar, purificar e preparar amostras de uma biomolécula de interesse; utilizar técnicas como cristalografia de raio-x, cryo-microscopia eletrînica, e ressonância magnética nuclear, para obter uma “imagem” do sistema biológico; e ,por fim, realizar uma modelagem atômica do sistema de interesse. Todas essas “estruturas resolvidas” estão disponível online no Protein Data Bank. Com o esforço da comunidade científica, hoje temos mais de 100 mil estruturas resolvidas, tamanha quantidade de dados foi vista com bom olhos pelos cientistas de dados. Em 2021, a empresa DeepMind, criou um modelo baseado inteligência artificial capaz de resolver a estrutura de proteínas com uma resolução menor do que um átomo de carbono, o AlphaFold2. Esse avanço abriu o campo da biologia estrutural para um nova era, em que seremos capazes desenhar proteínas com funções específicas visando, por exemplo, o tratamento de doenças.

Sobre o tutor

Victor Klein de Sousa é licenciado e mestre em física pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo. Atualmente é estudante de doutorado no Copenhagen Bioscience PhD Programme, pela Universidade de Copenhage, Dinamarca, trabalhando no Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research. Victor atua na área de biofísica e biologia estrutural, pesquisando a estrutura, função e mecanismo de ação de máquinas moleculares, peptídeos antimicrobianos e complexos proteicos.